לאור הקושי הקיים במוסדות החינוך לקיים לימודים כבשגרה, מכללת אפקה מקיימת שיתופי פעולה עם בתי ספר יסודיים ומאפשרת הגעה של תלמידים אל שטח הקמפוס ולמידה בכיתות הלימוד הממוגנות.

עד כה אירחה המכללה תלמידי כיתות ד'- ו' מבית הספר הדמוקרטי בהוד השרון, מבית הספר הכפר הירוק ומתיכון ליידי דייויס. 

 

אירוח בתי ספר