הנדסת מערכות עוסקת במערכות רב-תחומיות – למשל מערכות משולבות של מכניקה, חשמל ותוכנה. אלה מערכות מורכבות, מכמה וכמה בחינות: טכנית, הנדסית, כלכלית וסביבתית, וגם מבחינת צורכי המשתמשים. מהנדסי המערכות הם שמגדירים, מתכללים ומאפיינים את כל ההיבטים הללו, ומתרגמים את צורכי המשתמשים למונחים הנדסיים וטכניים, לטובת פיתוח של מערכות יעילות, בטוחות ומספקות ככל האפשר. ד"ר משה איל, מרצה בכיר בתוכנית להנדסת מערכות מסביר על התחום, על תוכנית הלימודים של אפקה ועל אפשרויות התעסוקה של בוגרות ובוגרי התואר.